院长：
副院长：张小汉、徐厚谦、黄希杰、王小平、王培祥
直属党支部书记：张小汉
副书记：马应孝、黄希杰
藏医学院下设办公室、教务科、总务科、学生科（招生与就业指导办公室）、医学教育研究室（教学督导与评估办公室）、信息管理中心等6个职能科室和藏医临床、藏医基础、藏药、西医临床、西医基础、公共等6个学科组。